Theo báo cáo, dự toán chi được Quốc hội quyết định là 1.177.100 tỉ đồng trong khi con số quyết toán là 1.265.625 tỉ đồng. 

Sai sót xảy ra ở nhiều bộ ngành, địa phương trong chi đầu tư và chi thường xuyên.

Cụ thể, trong chi đầu tư, dự toán 225.000 tỉ đồng, quyết toán 308.853 tỷ đồng, tăng 83.853 tỉ đồng so với dự toán.

Kiểm toán nhà nước nhận định trong công tác khảo sát, lập, thẩm tra, thẩm định và phê duyệt thiết kế, dự toán thì hồ sơ khảo sát của nhiều dự án còn chưa đầy đủ, thiếu chính xác. Hồ sơ thiết kế không phù hợp với tiêu chuẩn kỹ thuật và quy trình thiết kế, dự toán được thẩm tra, thẩm định nhưng khi phê duyệt vẫn còn sai sót.

Qua kiểm toán 46 dự án nhóm A, Kiểm toán nhà nước phát hiện trường hợp cá biệt có tổng giá trị dự toán vượt tổng mức đầu tư được duyệt. Đó là tổng mức đầu tư Dự án xây dựng Trụ sở mới Bộ Ngoại giao vượt tổng giá trị dự toán tới 1.940 tỷ đồng (5.952,6 tỉ đồng/4.022,6 tỉ đồng).

Công tác nghiệm thu, thanh toán còn nhiều sai sót về khối lượng, đơn giá, định mức hoặc chưa đầy đủ thủ tục, hồ sơ; còn tình trạng nghiệm thu, thanh toán khối lượng chưa thi công: Tỉnh Quảng Ninh: Dự án Hạ tầng kỹ thuật khu quảng trường gắn với tượng đài, nhà bảo tàng, thư viện trung tâm hội nghị hội thảo quốc tế Móng Cái 2,62 tỷ đồng; Sơn La: Dự án Đường giao thông Púng Bánh - Nậm Mằn và Dự án Nâng cấp đường Trung tâm huyện lỵ Sốp Cộp - cửa khẩu Lạnh Bánh, huyện Sốp Cộp 1,41 tỉ đồng;...

Kết quả kiểm toán 1.228 dự án của các bộ, cơ quan trung ương và địa phương, Kiểm toán nhà nước đã kiến nghị giảm trừ 12.399 tỉ đồng.

Về chi mua sắm tài sản, nhiều đơn vị trang bị ôtô và xe chuyên dùng không đúng tiêu chuẩn, như UBND tỉnh Đắk Lắk cho phép 7 huyện mua mới 8 xe chuyên dùng có tổng giá trị 9 tỉ đồng. Các huyện đều giao xe cho các doanh nghiệp tư nhân, hợp tác xã quản lý, sử dụng để thực hiện công tác vệ sinh môi trường là chưa đúng quy định....

Về chi thường xuyên, dự toán được Quốc hội phê duyệt là 777.000 tỉ đồng trong khi đó quyết toán 788.500 tỉ đồng, tăng 11.500 tỉ đồng so dự toán.

Kết quả kiểm toán cho thấy nhiều bộ, cơ quan trung ương, địa phương quyết toán một số khoản chi không đúng chế độ, tiêu chuẩn, định mức. Kiểm toán nhà nước đã kiến nghị thu hồi, nộp ngân sách nhà nước 116,8 tỉ đồng.

Ngoài ra, một số khoản vay trái phiếu trong năm của địa phương nhưng đến hết năm 2015 không giải ngân hết làm giảm hiệu quả sử dụng vốn vay. Như Hải Phòng, vốn vay chưa giải ngân 266 tỉ đồng; tỉnh Cà Mau 75,6 tỉ đồng….

Cá biệt, tỉnh Quảng Ninh phát hành trái phiếu nhưng phân bổ, sử dụng không kịp thời 800 tỉ đồng khoản vay năm 2013, đến ngày tháng 9-2015 mới phân bổ, sử dụng hết; phát hành 550 tỉ đồng vào tháng 12-2015 nhưng đến tháng 8-2016 mới phân bổ, sử dụng hết.

Chính vì vậy, Kiểm toán nhà nước kiến nghị Chính phủ chỉ đạo Bộ Tài chính, các bộ, cơ quan trung ương, địa phương, đơn vị được kiểm toán thực hiện đầy đủ, kịp thời kiến nghị về xử lý tài chính của KTNN trong năm 2016 đối với niên độ ngân sách 2015: 38.775,9 tỷ đồng. Các khoản giảm chi 16.173,6 tỉ đồng.