Diễn biến vụ việc như sau:

* Lúc 3g30 ngày 13-5-2012: Công an TP Tuy Hòa phối hợp Công an huyện Tây Hòa và Công an xã Hòa Đồng đến bắt ông Ngô Thanh Kiều (lúc này đang ngủ tại nhà riêng) và đưa ông về trụ sở công an xã vì cho rằng ông Kiều tham gia cùng Trần Minh Cường và Ngô Thanh Sơn thực hiện nhiều vụ trộm cắp trên địa bàn TP Tuy Hòa và thị xã Sông Cầu (tỉnh Phú Yên).

* Từ 8g sáng đến 13g chiều 13-5-2012: các bị cáo Nguyễn Thân Thảo Thành, Nguyễn Minh Quyền, Phạm Ngọc Mẫn, Nguyễn Tấn Quang, Đỗ Như Huy dùng dùi cui cao su đánh vào người ông Kiều khi xét hỏi ông này, không cho nghi phạm ăn uống.

Khi được đưa đến Phòng cảnh sát điều tra tội phạm về trật tự xã hội Công an Phú Yên vào lúc 14g cùng ngày, ông Kiều mệt mỏi và biểu hiện sức khỏe rất yếu nên được chuyển đến Bệnh xá Công an Phú Yên để chăm sóc, vào chiều tối cùng ngày thì chuyển đến Bệnh viện đa khoa Phú Yên cấp cứu nhưng ông đã chết ngoại viện.

* Ngày 20-6-2012: Bản giám định pháp y của Trung tâm Pháp y tỉnh Phú Yên kết luận Ngô Thanh Kiều chết do chấn thương sọ não, chấn thương phần mềm trên cơ địa có viêm phổi. Ngày 20-1-2013, Trung tâm Pháp y Phú Yên giải thích nguyên nhân chính dẫn đến cái chết của ông Kiều là do chấn thương sọ não.

* Ngày 6-8-2012 và ngày 9-1-2013: Cơ quan điều tra Viện KSND tối cao lần lượt khởi tố các bị can: Nguyễn Tấn Quang, Nguyễn Minh Quyền, Phạm Ngọc mẫn, Nguyễn Thân Thảo Thành và Đỗ Như Huy tội “dùng nhục hình”.

* Ngày 15-1-2013: Nguyễn Thân Thảo Thành bị bắt tạm giam; 4 bị cáo còn lại được tại ngoại.

* Ngày 28-4-2013: Viện KSND TP Tuy Hòa ra cáo trạng truy tố Nguyễn Thân Thảo Thành theo khoản 3 Điều 298 Bộ luật hình sự về tội “dùng nhục hình”, bốn bị cáo còn lại cũng bị truy tố theo Điều 298 nhưng ở khoản 2.

* Ngày 22-5-2013: Viện KSND TP Tuy Hòa ra cáo trạng mới thay thế cáo trạng ngày 28-4-2013, trong đó nội dung thay đổi duy nhất là truy tố 4 bị cáo tại ngoại ở khoản 1 Điều 298 Bộ luật hình sự.

* Ngày 28-6-2013: TAND TP Tuy Hòa trả hồ sơ đề nghị Viện KSND TP Tuy Hòa điều tra bổ sung cơ chế hình thành vết thương trên người Ngô Thanh Kiều, công cụ tác động gây thương tích trên người bị hại; truy cứu trách nhiệm năm bị can về hành vi “cố ý gây thương tích”.

* Ngày 26-8-2013: Viện KSND TP Tuy Hòa có văn bản trả lời TAND TP Tuy Hòa, không chấp nhận các yêu cầu điều tra bổ sung của tòa.

* Các ngày 26, 27, 28, 29-3 và 3-4-2014: TAND TP Tuy Hòa xét xử sơ thẩm vụ án “dùng nhục hình”, tuyên phạt Nguyễn Thân Thảo Thành 5 năm tù, Nguyễn Minh Quyền 2 năm tù, Phạm Ngọc Mẫn 1 năm 6 tháng tù, Nguyễn Tấn Quang 1 năm 3 tháng tù nhưng cho hưởng án treo, Đỗ Như Huy 1 năm tù cho hưởng án treo; các bị cáo bồi thường cho gia đình nạn nhân 111 triệu đồng; Công an TP Tuy Hòa cấp dưỡng hai con nhỏ của ông Kiều 575.000 đồng/tháng/cháu.

* Tháng 4-2014: Chủ tịch nước yêu cầu viện trưởng VKSND tối cao và chánh án TAND tối cao kiểm tra, chỉ đạo xét xử vụ án nghiêm minh theo đúng qui định pháp luật.

* Ngày 14-4-2014: Các đoàn công tác của VKSND tối cao và TAND tối cao đến Phú Yên làm việc với các cơ quan tố tụng tỉnh này về vụ án.

* Ngày 29-4-2014: viện trưởng VKSND tỉnh Phú Yên kháng nghị phúc thẩm, đề nghị hủy án sơ thẩm để điều tra, xét xử năm bị cáo cùng ở khoản 3 Điều 298 Bộ luật hình sự; xem xét trách nhiệm ông Lê Đức Hoàn (phó trưởng Công an TP Tuy Hòa) có dấu hiệu phạm tội “thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”.

* Ngày 24-6-2014: phiên tòa phúc thẩm được mở tại TAND tỉnh Phú Yên nhưng phải tạm hoãn sau phần thẩm tra lý lịch nhưng người tham gia tố tụng do vắng nhiều nhân chứng quan trọng, trong đó có ông Lê Đức Hoàn.

* Ngày 8 và 9-4-2014: phiên tòa phúc thẩm được mở lại.