Trước đó, bà Trương Thị Hải Yến đã bị 18 cá nhân gửi đơn tới các cơ quan chức năng tố cáo việc bà vay nợ 268 tỉ đồng và 16 quyển sổ đỏ nhưng đến nay không trả. Nhiều người trong số những người tố cáo cho biết họ đã phải bán nhà để trả nợ những khoản vay khác khi cho bà Yến vay, dẫn đến việc họ không còn nơi ở. Nhiều ngày qua, những chủ nợ này đã căng băngrôn đòi nợ và dọn đồ đạc đến Trường Phương Nam để gây sức ép đòi bà Yến trả lại tiền. Việc này dẫn đến Công an phường Định Công, quận Hoàng Mai phải bố trí lực lượng ứng trực 24/24g tại khu vực Trường Phương Nam để ổn định an ninh trật tự, an toàn cho giáo viên, học sinh của trường.

Trước đó, như Tuổi Trẻ đã phản ánh, đầu tháng 8-2013, một số phụ huynh có con đang học tại Trường tiểu học Phương Nam (nằm trong hệ thống Trường THPT dân lập Phương Nam) bất ngờ nhận được tin nhắn từ giáo viên chủ nhiệm cho biết theo chỉ đạo của ban giám hiệu, yêu cầu phụ huynh tới làm thủ tục chuyển trường cho con, trong khi vào thời điểm đó tất cả các trường trên địa bàn Hà Nội đều đã kết thúc việc tuyển sinh để chuẩn bị bước vào năm học mới.

Theo bà Bùi Thị Thanh, trưởng Phòng GD-ĐT quận Hoàng Mai, tính tới trước khi công bố ngừng hoạt động, Trường tiểu học Phương Nam có 42 học sinh các lớp 2,3,5. Sau khi trường tiểu học giải thể, hệ thống Trường THPT dân lập Phương Nam còn trên 400 học sinh cấp THCS và THPT.