Đây là các dự án thủy điện tác động lớn đến môi trường sinh thái, ảnh hưởng đến các quy hoạch phát triển kinh tế khác.

Các dự án thủy điện vừa bị đề nghị hủy quy hoạch gồm thủy điện Sông Đằn (công suất 1MW) tại huyện miền núi Thường Xuân, thủy điện Sông Chàng (công suất 3MW) tại huyện Như Xuân, thủy điện Suối Khứ (còn gọi là suối Khó, công suất 1MW) ở huyện vùng cao Quan Hóa, thủy điện Hón Nưa (công suất 1MW) ở huyện Quan Hóa, thủy điện Hủa Vọng (công suất 1MW) ở huyện vùng cao Mường Lát.

Bên cạnh đó, UBND tỉnh cũng có quyết định tạm dừng, chưa đầu tư xây dựng trước năm 2015 đối với dự án thủy điện Tam Lư (công suất 6MW) trên sông Lò, huyện vùng cao Quan Sơn.

Được biết, hiện nay tại Thanh Hóa có các dự án thủy điện đã hoạt động, phát điện là thủy điện Sông Mực (huyện Như Thanh), thủy điện Cửa Đặt (huyện Thường Xuân, công suất 97MW, dùng nước của công trình thủy lợi Cửa Đặt), thủy điện Bá Thước 2 ở huyện Bá Thước đã phát điện tổ máy số 1 (gồm 4 tổ máy), các tổ máy còn lại sẽ phát điện sau Tết Quý Tỵ 2013.

Các dự án thủy điện đang được triển khai xây dựng tại Thanh Hóa gồm thủy điện Trung Sơn, thủy điện Hồi Xuân ở huyện Quan Hóa; thủy điện Sông Âm, thủy điện Trí Năng ở huyện Lang Chánh; thủy điện Bá Thước 1 và Bá Thước 2 ở huyện Bá Thước.