Tại hội thảo, nhiều đại biểu cho rằng việc né tránh và không đưa ra quy định rõ ràng về hoạt động tại các trường ĐH ngoài công lập là có lợi nhuận hay phi lợi nhuận là “một sai lầm của ban soạn thảo”. Sự thiếu rõ ràng giữa hai cơ chế này ở hệ thống các văn bản đã ban hành chính là nguyên nhân chủ yếu của những tiêu cực đang diễn ra trong khối các trường ngoài công lập hiện nay.

Đặc biệt, nội dung “Bộ GD-ĐT tổ chức biên soạn giáo trình sử dụng chung, để làm tài liệu giảng dạy, học tập chính thức trong tất cả các cơ sở giáo dục đại học” vấp phải sự phản ứng khá dữ dội. Các chuyên gia giáo dục cho rằng “Bộ không thể giỏi bằng các chuyên gia chuyên ngành trong xây dựng chương trình giáo dục thực tế”.

TS Lê Viết Khuyến - nguyên vụ phó Vụ Đào tạo ĐH (Bộ GD-ĐT) - khẳng định đây là một yêu cầu “quá tầm” đối với bộ: “Đã từng tham gia quản lý Vụ Đào tạo ĐH nên tôi nắm rất rõ, số lượng chuyên viên của vụ không thể làm xuể nhiệm vụ này. Chưa kể, hoạt động của các chuyên viên từ lâu theo hình thức “khoán”, một chuyên viên phụ trách một số trường nhất định. Khi đó, chuyên viên này sẽ phải “quét” hết nội dung giáo trình của hàng chục ngành, khoa của trường là chuyện không tưởng”.