Nhiều tham luận của các kiểm sát viên cho rằng còn nhiều vướng mắc trong các quy định của Bộ luật hình sự chưa được các ngành tư pháp hướng dẫn cụ thể, từ đó dẫn đến tình trạng vênh nhau trong việc áp dụng điều luật. Cần phải có quy định cụ thể về định lượng (số lượng bao nhiêu thì gọi là lớn, rất lớn, đặc biệt lớn), hướng dẫn như thế nào là hậu quả nghiêm trọng, rất nghiêm trọng, đặc biệt nghiêm trọng.

Theo bà Nguyễn Ngọc Điệp - phó viện trưởng Viện KSND TP.HCM, vấn nạn ô nhiễm môi trường đang gây bức xúc cho người dân nhưng từ đó đến nay TP.HCM chưa truy tố, xét xử được vụ nào cũng chính vì vướng mắc quy định của điều luật, chưa có hướng dẫn thế nào là “gây hậu quả nghiêm trọng”. Gần đây xuất hiện nhiều tội phạm trong lĩnh vực ngân hàng, một lĩnh vực rất nhạy cảm, nhưng quy định của Bộ luật hình sự cũng còn nhiều vấn đề chưa rõ, cần phải được hướng dẫn cụ thể trong áp dụng điều luật.

Tại hội thảo, thẩm phán Vũ Phi Long - phó chánh tòa hình sự TAND TP.HCM - nói có tình trạng cùng một hành vi nhưng các cơ quan tố tụng lại có cách định tội khác nhau. Nhiều vụ sai phạm tập thể như dùng tiền nhà nước để chi bồi dưỡng, tiếp khách, khi TAND TP.HCM xét xử về tội “cố ý làm trái” thì lên phúc thẩm lại sửa án, tuyên phạt các bị cáo về tội “sử dụng trái phép tài sản” với mức án nhẹ hơn.