Điều đáng lưu ý là trong văn bản này, Sở Tài nguyên - môi trường cho rằng việc buộc BCI phải đóng phí bảo vệ môi trường đối với bùn thải là không phù hợp.

Ba căn cứ để sở cho rằng “không phù hợp” là: Thứ nhất, hiện nay TP.HCM chưa ban hành mức thu phí bảo vệ môi trường đối với chất thải nguy hại. Thứ hai, Cục Cảnh sát phòng chống tội phạm về môi trường (C49) lập biên bản vi phạm đối với BCI ngày 18-12-2009. Trước đó, ngày 16-11-2009, Bộ Tài nguyên - môi trường đã có thông tư số 25 ban hành quy chuẩn về ngưỡng chất thải nguy hại, theo quy chuẩn này bùn thải của BCI không được coi là chất thải nguy hại. Thứ ba, việc tính khối lượng bùn thải nguy hại của C49 đối với BCI là chưa hợp lý.

Trong ba điểm Sở Tài nguyên - môi trường cho rằng “không phù hợp” lại có đến hai điểm... không phù hợp. Cụ thể, theo biên bản vụ việc quả tang ngày 17-4-2009, số lượng bùn thải đổ ra môi trường ở Khu công nghiệp Lê Minh Xuân (căn cứ trên nhật ký đổ bùn) ước tính lên đến hơn 1.500 tấn. Sau đó BCI mặc cả, đề nghị C49 cân đo lại mấy lần và đã ký vào biên bản vi phạm với tổng lượng bùn hơn 836 tấn.

Vì thế, đến nay sở lại cho rằng việc C49 tính khối lượng bùn thải vi phạm đổ ra môi trường “chưa chính xác do bùn thải có độ ẩm vào từng thời điểm là khác nhau” chẳng khác nào phủ nhận con số mà chính BCI đã thừa nhận. Mặt khác, thông tư 25 được Bộ Tài nguyên - môi trường ban hành ngày 16-11-2009 nhưng phải đến ngày 1-1-2010 mới có hiệu lực, trong khi từ ngày 28-12-2009 C49 đã ra quyết định xử phạt vi phạm hành chính BCI và quyết định này có hiệu lực kể từ ngày ký.

Chưa kể, hành vi đổ bùn thải ra môi trường của BCI đã bị C49 bắt quả tang từ ngày 17-4-2009 và kết quả phân tích xác định đây là chất thải nguy hại. Do đó, không thể áp dụng quy chuẩn ngưỡng chất thải nguy hại do Bộ Tài nguyên - môi trường ban hành sau khi hành vi vi phạm đã bị phát hiện và xử lý hành chính để nói rằng bùn thải của BCI không phải là chất thải nguy hại. Riêng lý do TP.HCM chưa ban hành mức thu phí bảo vệ môi trường đối với chất thải nguy hại là một thực tế mà chính các cơ quan chức năng TP.HCM thừa nhận là đã bỏ ngỏ lâu nay.