Bệnh viện có 4 trung tâm trực thuộc: Trung tâm Tim mạch, Trung tâm Chấn thương chỉnh hình, Trung tâm Đào tạo và Chỉ đạo tuyến, Trung tâm Hồi sức tích cực quốc gia điều trị COVID-19, cùng 47 khoa/phòng.

Ngoài nhiệm vụ chính là chăm sóc sức khỏe cho 20 triệu người dân khu vực Đồng bằng sông Cửu Long, Bệnh viện còn là cơ sở thực hành cho học sinh, sinh viên các trường đào tạo y khoa trên địa bàn TP Cần Thơ: Đại học Y Dược Cần Thơ, Cao đẳng Y tế Cần Thơ, Đại học Tây Đô, Đại học Nam Cần Thơ...

Hơn 12.000 kỹ thuật chuyên khoa đã được phê duyệt thực hiện theo danh mục kỹ thuật của Bộ Y tế. Trong đó các kỹ thuật chuyên khoa sâu được thực hiện như: Phẫu thuật tim hở, phẫu thuật nội soi ổ bụng, nội soi khớp gối, khớp vai, phẫu thuật thay khớp gối, khớp háng, phẫu thuật phình động mạch chủ, phẫu thuật thần kinh, vi mạch máu, vi phẫu tạo hình thẩm mỹ, phẫu thuật điều trị thoát vị đĩa đệm cột sống cổ, cột sống lưng qua lối trước và lối sau, phẫu thuật chấn thương cột sống, lồng ngực, mạch máu, sản khoa. Thực hiện can thiệp mạch vành, can thiệp mạch não, can thiệp nội mạch điều trị chấn thương gan, thận, lách…

Song song với sự phát triển về nhân lực, bệnh viện đã trang bị những thiết bị y tế hiện đại trong khu vực: 3 hệ thống DSA (trong đó có hệ thống DSA hai bình diện), 2 máy MRI (1.5 TESLA và 3.0 TESLA), 3 máy CTScan đa lát cắt, máy nội soi phóng đại, siêu âm đo độ đàn hồi gan Fibroscan, siêu âm xuyên sọ, đo điện tim gắng sức, C-arm, máy đo độ loãng xương phục vụ công tác cấp cứu, chẩn đoán và điều trị kịp thời cho người bệnh.

Tầm nhìn đến năm 2025, Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ sẽ thành bệnh viện hạng đặc biệt, chuẩn bị đầy đủ cơ sở vật chất, nhân lực triển khai đề án ghép tạng, phẫu thuật tim nhi, thành lập đơn vị nhi - sơ sinh, đơn vị nhịp học… đồng thời ứng dụng khoa học công nghệ, trí tuệ nhân tạo vào công tác chẩn đoán và điều trị.

Với sứ mệnh chăm sóc sức khỏe người dân khu vực Đồng bằng sông Cửu Long, Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ không ngừng nỗ lực xây dựng và phát triển, mang lại giá trị và chất lượng chăm sóc sức khỏe cho người dân.