Bộ Giáo dục và Đào tạo nêu rõ phạm vi nội dung thi theo chương trình giáo dục trung học phổ thông hiện hành và chương trình chuyên sâu các môn chuyên cấp trung học phổ thông ban hành kèm theo Công văn số 10803/BGDĐT-GDTrH ngày 16-12-2009 của Bộ Giáo dục và Đào tạo.

Riêng đối với thi thực hành các môn Vật lí, Hóa học và Sinh học, phạm vi và nội dung thi được quy định như sau: môn Vật lí gồm phần cơ học, điện học, quang học; môn Hóa học: phân tích định lượng; môn Sinh học: sinh thái thích nghi ở thực vật; hóa sinh và tế bào học; sinh lý học thực vật và vi sinh học.

Về hình thức thi, trong kỳ thi học sinh giỏi quốc gia năm 2016, tiếp tục tổ chức thi nói (độc thoại) của thí sinh đối với các môn ngoại ngữ và thi thực hành đối với các môn Vật lí, Hóa học, Sinh học.

Lịch tổ chức thi được quy định như sau: các hội đồng coi thi tổ chức 3 buổi thi; thời gian bắt đầu làm bài của mỗi buổi thi là 08g00.

Ngày 06-01-2016: thi viết các môn Toán, Vật lí, Hóa học, Sinh học, Ngữ văn, Lịch sử, Địa lí, tiếng Anh, tiếng Nga, tiếng Pháp, tiếng Trung Quốc và thi lập trình trên máy vi tính môn Tin học.

Ngày 07-01-2016: thi viết các môn Toán, Vật lí, Hóa học, Sinh học; thi nói các môn tiếng Anh, tiếng Nga, tiếng Pháp, tiếng Trung Quốc và thi lập trình trên máy vi tính môn Tin học.

Ngày 08-01-2016: thi thực hành các môn Vật lí, Hóa học và Sinh học.