Đến nay vẫn còn 3/10 bệnh viện đa khoa trên địa bàn TP chưa có khoa y học cổ truyền, 14 phòng y tế của 24 quận, huyện chưa có cán bộ chuyên trách về y dược học cổ truyền, 155/322 trạm y tế phường, xã chưa có bộ phận khám chữa bệnh bằng y học cổ truyền.

Bác sĩ Vinh còn chỉ ra một số tồn tại như: một số cơ sở sản xuất đông dược chưa đáp ứng điều kiện sản xuất, trang thiết bị còn thô sơ, các kho chứa dược liệu không đảm bảo điều kiện bảo quản vệ sinh, độ ẩm.

Nhiều cơ sở kinh doanh bán thuốc đông y, thuốc từ dược liệu không rõ nguồn gốc. Một số người lợi dụng danh nghĩa y học cổ truyền để kinh doanh và khám chữa bệnh trái phép, không đúng quy định.