Người khai hải quan điện tử (NKHQĐT) được khai 24 giờ trong ngày, 7 ngày trong tuần và nhận thông tin phản hồi của cơ quan Hải quan trực tiếp qua hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan. Trường hợp khai hải quan trong thời gian nghỉ theo quy định của pháp luật nhưng thuộc diện phải nộp, xuất trình chứng từ thuộc bộ hồ sơ hải quan để cơ quan Hải quan kiểm tra, làm cơ sở thực hiện các thủ tục tiếp theo thì được phản hồi kết quả chậm nhất 4 tiếng đồng hồ kể từ thời điểm bắt đầu ngày làm việc kế tiếp.

NKHQĐT được sử dụng chứng từ in ra từ hệ thống khai hải quan điện tử (có đóng dấu và chữ ký của NKHQĐT); được lựa chọn hình thức nộp lệ phí hải quan và các loại phí do cơ quan Hải quan thu hộ các hiệp hội, tổ chức (nếu có) cho từng tờ khai hải quan hoặc nộp gộp theo tháng; được cơ quan Hải quan cung cấp thông tin về quá trình xử lý hồ sơ hải quan điện tử thông qua hệ thống xử lý dữ liệu điện tử hải quan. Đồng thời, NKHQĐT có nghĩa vụ thực hiện việc lưu giữ chứng từ điện tử thuộc hồ sơ hải quan (bao gồm cả bản sao) theo quy định của Luật giao dịch điện tử và các văn bản quy phạm pháp luật liên quan; cung cấp các chứng từ điện tử để phục vụ công tác kiểm tra, thanh tra theo thẩm quyền; khi thực hiện thủ tục, NKHQ phải sử dụng chữ ký số đã đăng ký với cơ quan Hải quan.

Nghị định có hiệu lực thi hành kể từ ngày 1-1-2013.