Mức phạt hành chính cao nhất lên tới 100 triệu đồng được áp dụng cho các vi phạm quy định về thành lập cơ sở giáo dục trái phép. Mức phạt cao nhất từ 60-100 triệu đồng được xử phạt đối với việc thành lập trường ĐH trái phép. Hành vi tổ chức hoạt động giáo dục khi chưa được cơ quan có thẩm quyền cho phép hoặc hành vi cho phép sai thẩm quyền sẽ bị xử phạt đến tối đa 10 triệu đồng.

Ngoài xử phạt bằng tiền, quy định cũng có các hình thức xử phạt bổ sung và biện pháp khắc phục hậu quả đối với các hành vi kể trên. Trong đó có việc buộc đình chỉ hoạt động giáo dục và trả lại cho người học số tiền đã thu.

Nghị định này còn bổ sung các mức phạt hành chính đối với các hành vi liên quan liên kết đào tạo, đào tạo và cấp chứng chỉ... không đúng quy định của pháp luật.