Hiện các chuyến tàu đến và xuất phát từ ga Hà Nội (nằm ở trung tâm thành phố) chủ yếu vào ban đêm hoặc sáng sớm. Một số đoàn tàu địa phương phải xuất phát và dừng ở ga Long Biên khi tới Hà Nội. Cụ thể, tại ga Hà Nội, phần lớn chuyến tàu chạy trên tuyến đường sắt Thống Nhất đều xuất phát vào buổi tối. Chỉ có ba chuyến xuất phát ban ngày là tàu SE7 xuất phát vào 6g15, SE5 xuất phát vào 9g, TN1 xuất phát lúc 13g15. Còn các chuyến tàu từ TP.HCM, Huế, Nghệ An đến Hà Nội vào ga từ 3g-5g sáng. Chỉ có tàu SE20 vào ga Hà Nội lúc 8g30 và tàu SE8 vào ga lúc 15g07.

Tuy nhiên, việc phần lớn đoàn tàu khách được vào, ra ga Hà Nội vào buổi tối, sáng sớm (trước giờ cao điểm) khiến ngành đường sắt gặp khó khăn khi đón trả khách tại các ga Long Biên, Giáp Bát. Theo Tổng công ty Đường sắt VN, các ga này không đủ điều kiện cơ sở vật chất phục vụ khách đi tàu. Bên cạnh đó, hành khách xuống các ga Giáp Bát, Long Biên phải trung chuyển bằng phương tiện khác vào nội ô nên phát sinh chi phí.

Trước kiến nghị của Đường sắt VN, tháng 6-2013 Bộ Giao thông vận tải có văn bản đề nghị UBND TP Hà Nội cho phép hai đôi tàu khách địa phương từ phía Bắc và một đôi tàu khách địa phương từ phía Nam ra vào ga Hà Nội đón trả khách vào ban ngày (không vào giờ cao điểm). Các đoàn tàu khách bị chậm do tai nạn hoặc thiên tai, bão lũ cũng được phép vào TP ban ngày (không vào giờ cao điểm) để có thể sớm trả khách theo hành trình quy định.

Chiều 11-8, ông Nguyễn Văn Bính - phó tổng giám đốc Công ty Vận tải hành khách đường sắt Hà Nội - cho biết trước đề nghị của Bộ Giao thông vận tải cũng như Đường sắt VN, UBND TP Hà Nội đã đề nghị ngành đường sắt nghiên cứu để trình đề án về việc tăng thêm tàu vào ga Hà Nội ban ngày (ngoài giờ cao điểm). Việc tăng tàu phải đảm bảo an toàn giao thông, chống ùn tắc giao thông, có phương án cụ thể về việc tăng cường nhân lực canh gác, báo hiệu tại các đường ngang. “Chúng tôi đang làm việc với Sở Giao thông vận tải Hà Nội, tiến hành khảo sát theo ý kiến của UBND TP Hà Nội” - ông Bính cho biết.