Họ đại tiện trong kiểu nhà vệ sinh thùng, sau đó chôn lấp vào cát và xử lý bằng Chloramine B. Một số rất ít đảo có nhà vệ sinh tự hoại, nhưng cũng chỉ để cho khách ra thăm đảo sử dụng.

Bộ đội sử dụng nhà vệ sinh thùng bởi Trường Sa chưa đủ nước ngọt. Hệ thống vệ sinh tự hoại phải sử dụng bằng nước ngọt, bởi nước mặn không thể tự hoại được các chất thải. Trường Sa bây giờ đã có nhiều biện pháp để đảm bảo đủ nước ngọt cho ăn uống, trồng rau, tưới cây, chứ chưa đủ nước ngọt cho các sinh hoạt.

Trung tướng Chu Tiến Cường khi đó còn là cục trưởng Cục Quân y (Bộ Quốc phòng) ra thăm đảo đầy trăn trở. Theo ông, trước mắt chưa thể giải quyết ngay được vấn đề nước ngọt để đảm bảo phục vụ cho các nhà vệ sinh tự hoại thì giải pháp trước mắt là tăng cường Chloramine B cho các đảo và yêu cầu các chiến sĩ phải tuân thủ nghiêm quy trình vệ sinh. Tuy nhiên, Chloramine B giá thành không rẻ nên đây chỉ là giải pháp trước mắt. Trăn trở của ông không phải không có lý. Chỉ cần một dịch bệnh xảy ra thì thật khó nói trước điều gì. Đảo xa đất liền, các điều kiện y tế còn nhiều khó khăn nên việc xử lý dịch bệnh nếu có cũng thật gian nan.

Như vậy muốn giải quyết được vấn đề nhà vệ sinh cho bộ đội đảo thì bài toán trước tiên là phải giải quyết được vấn đề nước sạch, đây là bài toán cần sự chung tay của các cấp, ngành, các tổ chức và toàn xã hội.