Theo đó, Thủ tướng Chính phủ giao Bộ GD-ĐT soạn thảo, trình Chính phủ xem xét, thông qua trong Quý IV/2007 để trình Quốc hội Dự án Luật sửa đổi, bổ sung Điều 51 Luật Giáo dục năm 2005 theo hướng giao Bộ trưởng Bộ GD-ĐT thẩm quyền quyết định thành lập trường ĐH công lập, cho phép thành lập trường ĐH tư thục và sửa đổi, bổ sung điểm b khoản 1 Điều 42 Luật Giáo dục theo hướng giao cho Bộ trưởng Bộ GD-ĐT thẩm quyền giao nhiệm vụ đào tạo thạc sĩ, tiến sĩ cho các trường ĐH, viện nghiên cứu khoa học.

Bên cạnh đó, soạn thảo, trình Thủ tướng Chính phủ trong Quý IV/2007 dự thảo Quyết định của Thủ tướng Chính phủ quy định thủ tục thành lập, đình chỉ hoạt động, sáp nhập, chia, tách, giải thể trường ĐH theo quy định tại Điều 51 Luật Giáo dục năm 2005.

Đồng thời, chủ trì, phối hợp với Bộ Nội vụ soạn thảo, trình Chính phủ trong Quý IV/2007 dự thảo Nghị định sửa đổi, bổ sung khoản 4 Điều 4 Nghị định số 07/2001/NĐ-CP ngày 1-2-2001 của Chính phủ về ĐH Quốc gia theo hướng giao cho Giám đốc ĐH Quốc gia thẩm quyền quyết định thành lập, sáp nhập, chia tách, giải thể các đơn vị trực thuộc và sửa đổi, bổ sung Điều 6 Nghị định số 07/2001/NĐ-CP nêu trên theo hướng giao cho Bộ trưởng Bộ GD-ĐT thẩm quyền quyết định bổ nhiệm, miễn nhiệm, cho từ chức, cách chức Giám đốc, Phó giám đốc ĐH Quốc gia Hà Nội và ĐH Quốc gia TP.HCM.