Theo kinh nghiệm tại một số quốc gia trên thế giới như Hàn Quốc, Nhật Bản... cho thấy đối với những vụ việc mà quy định pháp luật còn chưa rõ ràng hoặc mâu thuẫn thì cơ quan thuế thường giải quyết theo hướng có lợi cho người nộp thuế.
Từ đó Bộ Tài chính đề xuất bổ sung quy định về bảo vệ người nộp thuế vào Luật Quản lý thuế theo hướng: Trong quá trình nộp thuế, người nộp thuế được quyền yêu cầu cơ quan thuế xem xét tính chính xác về số thuế phải nộp trước khi người nộp thuế nộp tiền vào ngân sách. Đặc biệt, người nộp thuế có quyền từ chối quyết định thanh tra, kiểm tra thuế nếu có sự trùng lắp về nội dung, thời kỳ quyết định thanh tra, kiểm tra về thuế trước đó hoặc có nội dung ngoài phạm vi đã nêu trong quyết định.
