Tuy vậy, quy mô vốn trung bình của dự án trong ngành nông nghiệp chỉ khoảng 7 triệu USD/dự án. Không những ít, phân bổ vốn FDI trong nông nghiệp cũng không đồng đều. Các dự án chủ yếu tập trung vào một số lĩnh vực như trồng rừng, chế biến gỗ và lâm sản, chăn nuôi và chế biến thức ăn chăn nuôi. Vốn đầu tư cho các ngành chế biến nông sản, thủy sản rất ít.
Theo các doanh nghiệp Nhật Bản, từ đầu năm 2016 đã có nhiều đoàn doanh nghiệp nước này tìm hiểu đầu tư vào thị trường nông nghiệp của Việt Nam, nhưng mới chỉ có một số ít đơn vị đầu tư vào lĩnh vực này với tỉ trọng vốn thấp. Hạn chế nông nghiệp của Việt Nam là sản xuất còn nhỏ lẻ, cơ sở hạ tầng và dịch vụ phụ trợ còn thiếu và yếu. Khó khăn để có quỹ đất và những thủ tục mất thời gian cũng là trở ngại khi đầu tư nông nghiệp tại Việt Nam.
