Theo qui chế mới, từ năm 2007, các kỳ thi HSG sẽ có những đổi mới, điều chỉnh quan trọng so với hiện nay. Trước hết là đề thi sẽ được cải tiến theo hướng thay đổi mạnh cấu trúc, khuyến khích ra câu hỏi trắc nghiệm. Đồng thời bộ có phương án lập ngân hàng câu hỏi thi cho các kỳ thi HSG, phục vụ việc rút thăm ngẫu nhiên để xây dựng đề thi. Đối với kỳ thi chọn HSG quốc gia sẽ có nhiều qui định mới về đối tượng, điều kiện dự thi, trong các khâu tổ chức thi…

Ông Ninh cho biết: Nhằm đảm bảo chất lượng HSG đoạt giải, dự kiến sẽ giảm số TS dự thi, mỗi đội tuyển sẽ có sáu TS/ môn thi (hiện nay là 10 TS). Những đội tuyển của đơn vị nào năm trước đạt kết quả cao về số giải sẽ được tăng số TS tham gia.

Đặc biệt, qui chế sẽ đưa ra một điều kiện quan trọng đối với các đội tuyển HSG là không liên hệ, mời người ngoài trường ôn luyện, tập huấn cho giáo viên và HS dự tuyển dưới bất kỳ hình thức và thời gian nào. Nếu phát hiện vi phạm, TS của đội đó sẽ không được dự thi hoặc bị hủy bỏ kết quả thi.

Cũng theo ông Nguyễn An Ninh, Bộ GD&ĐT đã cho thành lập một nhóm nghiên cứu sử dụng kết quả thi HSG quốc gia. Nhóm này đã thu thập được ý kiến của các cơ sở giáo dục đào tạo và các cơ quan quản lý giáo dục địa phương. Trong đó, số đông nghiêng về quan điểm không nên tuyển thẳng HS đoạt giải quốc gia, mà nên cộng điểm cho các TS khi thi vào ĐH, CĐ.