Kết luận số 582/TTr-P2 ngày 8.9.2015 của thanh tra Bộ tài chính khẳng định rõ: "Công tác quản lý dự án quốc lộ 1 vốn trái phiếu Chính phủ do Sở GTVT tỉnh Quảng Bình làm chủ đầu tư thấy dự án được quản lý đúng trình tự thủ tục đầu tư xây dựng. Thực tế các nhà thầu đã thi công nhanh hơn hợp đồng, vượt tiến độ 3 tháng và cam kết bảo hành công trình 4 năm”, có 2 gói thầu bảo hành 5 năm. Kết luận cũng chỉ ra: "Khi thực hiện dự án, Sở và các bên liên quan đã chủ động rà soát lại chi phí xây dựng công trình, chi phí QLDA, tư vấn, chi phí GPMB, chi phí dự phòng... từ đó tổng mức đầu tư còn 2.475 tỷ đồng, giảm 264 tỷ đồng sau khi điều chỉnh lần 1. Ngoài ra quỹ dự phòng của dự án hơn 700 tỷ đồng vẫn được bảo lưu đưa lại tiết kiệm ngân sách khá lớn.
Quốc lộ 1A đoạn do sở GTVT Quảng Bình làm chủ đầu tư.
Chủ đầu tư đã bám sát việc dự toán tính hàm lượng nhựa trên cơ sở quy trình, định mức thi công, nghiệm thu thanh toán theo tỷ lệ nhựa thực tế thi công nên chủ động không để tăng thêm 20 tỷ đồng. Trước những kết quả này, Thanh tra Bộ tài chính cũng yêu cầu Sở GTVT tiếp tục chiết giảm các gói thầu thêm 13 tỷ nhằm tiết kiệm tối đa. Ông Trần Văn Luận, Phó giám đốc sở GTVT Quảng Bình khẳng định việc chiết giảm này hiện Sở đang tiến hành theo quy trình và chắc chắn sẽ điều chỉnh giảm tốt để tiết kiệm thêm cho nguồn vốn trái phiếu Chính phủ.
Thanh tra cũng chỉ ra quy trình tính toán một số gói cụ thế đã có dôi dư hơn 4 tỷ đồng, yêu cầu Chủ đầu tư rút kinh nghiệm để điều chỉnh giảm nhằm không lãng phí bất cứ ngân khoản nào. Sở GTVT Quảng Bình cho biết, trước khi có kết luận thanh tra, Sở đã phê duyệt điều chỉnh giảm dự toán 1,105 tỷ ở 2 gói thầu 10 và 11. Hiện chỉ còn lại 3,095 tỷ (tương đương 0,12% giá trị tổng mức đầu tư) chưa điều chỉnh giảm ở 5 gói thầu còn lại.
Nguyên nhân chưa chính xác có cả yếu tố chủ quan và khách quan. Sở này khẳng định; dù nguyên nhân nào thì các bên liên quan cũng phải nghiêm túc rút kinh nghiệm.
Kết luận thanh tra có quan điểm: “Việc xây dựng, quản lý đơn giá cơ bản phù hợp với định mức của nhà nước và tính chất các công việc; việc đầu tư xây dựng công trình chủ yếu sử dụng các vật liệu (cát, đá, xi măng) tại địa phương theo quy hoạch của UBND tỉnh, gần với công trình, góp phần tiết kiệm chi phí đầu tư xây dựng công trình”. Ngoài ra chủ đầu tư cũng khẳng định qua rà soát không bị đội vốn mà tiết kiệm lớn cho ngân sách từ các điều chỉnh và chiết giảm kinh phí.
