Theo đề án, Trường ĐH Khoa học công nghệ Hà Nội sẽ là một trong bốn trường ĐH được Chính phủ đầu tư thành lập mới, với sự hỗ trợ của các đối tác nước ngoài. Mục tiêu đến năm 2020, trường được xếp hạng trong danh sách 200 trường ĐH hàng đầu thế giới.

Trường ĐH Khoa học công nghệ Hà Nội sẽ được thành lập trong năm 2009, với việc hình thành bộ máy tổ chức, tuyển sinh và đào tạo. Đến 2012, trường sẽ hoàn thành xây dựng cơ sở vật chất và mở được ít nhất ba khoa đào tạo trình độ ĐH, thạc sĩ, tiến sĩ.

Đến 2016, trường sẽ hoàn thiện trang bị cơ sở vật chất, thành lập các trung tâm nghiên cứu, mở thêm ít nhất 5-7 khoa đào tạo mới, thu hút sinh viên quốc tế đến học, có các công trình khoa học đăng trên tạp chí quốc tế.

Viện Khoa học công nghệ Việt Nam, ĐH Quốc gia Hà Nội hỗ trợ về nhân sự và cơ sở thực hành, thí nghiệm; đối tác nước ngoài cung cấp chương trình đào tạo, giảng viên và cán bộ quản lý. Hiệu trưởng và một số vị trí lãnh đạo chủ chốt trong 8-10 năm đầu có thể do các giáo sư của phía đối tác đảm nhận, phía Việt Nam tham gia quản lý và giữ vai trò chủ tịch hội đồng trường...

Phó thủ tướng Nguyễn Thiện Nhân chỉ rõ cần huy động nguồn cán bộ cấp cao, cán bộ của Viện Khoa học công nghệ Việt Nam để kiêm nhiệm hoặc biệt phái công tác tại Trường ĐH Khoa học công nghệ Hà Nội. Để đẩy nhanh tiến độ triển khai đề án, bảo đảm chất lượng, phải thành lập ngay ban quản lý để điều hành và xây dựng quy chế cho Trường ĐH Khoa học công nghệ Hà Nội hoạt động trong năm đầu. Ban quản lý có thể thay mặt Chính phủ thỏa thuận các hợp tác với đối tác Pháp để thực hiện hiệu quả đề án.

Được biết, Chính phủ sẽ đầu tư khoảng 100 triệu USD để xây dựng Trường ĐH Khoa học công nghệ Hà Nội. Trong quá trình vận hành, ngân sách nhà nước giữ vai trò chủ yếu kết hợp với nguồn học phí, nguồn thu từ hoạt động khoa học - công nghệ và các tài trợ khác. Trong giai đoạn đầu mới thành lập, Trường ĐH Khoa học công nghệ Hà Nội sẽ đặt tại Viện Khoa học công nghệ Việt Nam. Cơ sở chính trong tương lai được xây dựng trong khuôn viên 65ha Khu công nghệ cao Láng - Hòa Lạc.